Pada tahun 1962, En Benjamin Sia, telah dilantik sebagai Guru Besar pertama bukan mubaligh. sebuah klinik pergigian telah dibina hasil sumbangan Fr Bruggeman pada tahun 1974. Pada tahun 1979, enrolmen murid telah meningkat ke 414 dengan 16 orang guru dan bangunan asrama lelaki dibina pada tahun yang sama. En Henry Manggi menganti tempat En Benjamin Sia yang bersara wajib pada tahun 1983. Seterusnya En Henry digantikan oleh Pn Josephine Demang memangku tugas Guru Besar pada tahun 1990. Sk St Francis Xavier telah dinaikkan taraf ke sekolah Gred A dengan enrolmen murid meningkat 500 orang pada tahun 1993. |